Die Erklärung ist einfach: 

Synthetische Stoffe erzielen durch Patentrechte hohe Preise.
Damit lässt sich ein erfolgreiches Marketing finanzieren.

• Auch  der Staat benötigt stets Steuereinnahmen und ist somit an dieser Konstruktion beteiligt.
• Es gibt Staaten, die bei Arzneimitteln auf die Mehrwertsteuer verzichten, etwa Österreich.
• In Deutschland ist der Staat an jeder Arznei mit 19% (16%) beteiligt, was eine Interessenkollision ergibt:
• Die Genehmigung hoher Verkaufspreise kommt einer Steuererhöhung gleich.

Die Gesetzgebung ist "industriefreundlich" in dem Sinne, dass die teuere Lösung bevorzugt wird, auch wenn es eine einfache Lösung gegeben hätte.
Naturstoffe hingegen müssen daher ohne die Unterstützung von Staat, Geld und Lobby auskommen.
Daher werden sie nur von suchenden Menschen gefunden.
Der Allgemeinheit bleibt der Nutzen der nahezu kostenlosen Naturstoffe weithin verborgen.

Diese Darstellung macht sich keineswegs zur Aufgabe, hier eine Wertung auszusprechen.
Es soll lediglich die Frage beantwortet werden, warum Vitamin D so wenig Beachtung und Anerkennung findet. 
Ähnlich verhält es sich mit vielen einfachen Dingen des Lebens, die wir stets gegen ein ökonomisch denkendes System verteidigen müssen.